Anthropic обнаружила новые ферментные системы в бактериофагах с помощью ИИ-агентов

Используя ИИ-агенты Claude, компания Anthropic сделала прорыв в геномах бактериофагов, обнаружив неизвестную ранее ферментную систему. Эта находка включает длинные повторяющиеся последовательности ДНК, напоминающие CRISPR, хотя их функция пока остается загадкой.

Новая система, получившая название array-associated reverse transcriptases (ART), характеризуется повторяющимися последовательностями, схожими с массивами CRISPR. Исследователи поручили Claude искать обратные транскриптазы — ферменты, преобразующие РНК в ДНК, в 1,9 млрд белковых кластеров.

С помощью 950 агентов за 21 час было найдено более 200 000 обратных транскриптаз, из которых выделили около 3500 потенциально новых систем. Из них отобрали 20 самых перспективных для дальнейшего анализа, что позволило значительно сократить время исследований, которое могло бы занять несколько месяцев.

Claude обнаружил ДНК-повторы рядом с необычной обратной транскриптазой, изучив интервалы и сравнив структуру с известными системами. Хотя сама транскриптаза была описана ранее, новизна заключается в распознавании более крупной системы, включающей неизвестный ген и длинный массив повторяющихся ДНК.

Anthropic провела все лабораторные эксперименты, используя Claude для анализа данных и формирования гипотез. Компания работает на уровнях биобезопасности BSL-1 и BSL-2 и не занимается патогенами, опасными для человека.

CRISPR изначально обнаружили в виде повторяющихся ДНК в микроорганизмах, позже выяснив, что они участвуют в защите от бактериофагов. Исследователи нашли аналогичные повторяющиеся последовательности в ART, но их функция пока неизвестна.

Anthropic также укрепляет свои позиции в биологии, запустив Life Sciences Verification Program. Эта программа позволяет исследовательским командам использовать модели Mythos 5.1, Opus 5 и Sonnet 5 для биологических задач с новыми мерами безопасности.

Кроме того, Anthropic оптимизировала более 30 открытых моделей для биомолекулярных исследований, ускорив их в четыре раза в среднем. Компания также разработала режим с пониженным потреблением памяти для обработки крупных систем на одном GPU.

Совместно с Adaptyv Bio Anthropic организовала конкурс по дизайну белков, предоставляя до $1 млн в кредитах Claude и другие ресурсы. Они стремятся ускорить фундаментальные открытия в биологии с помощью ИИ, создав собственную лабораторию в районе залива Сан-Франциско.

В июле компания запустила среду Claude Science для ученых и заявила о планах разрабатывать препараты для сложных заболеваний. В августе исследователи Стэнфорда использовали ИИ для проектирования геномов бактериофагов, из которых 16 оказались эффективными против кишечной палочки.