Anthropic и Claude открывают новую ферментную систему в бактериофагах

Исследовательская группа Anthropic, используя ИИ-агенты Claude, выявила новую ферментную систему в геномах бактериофагов — вирусов, поражающих бактерии. Claude обнаружил необычную обратную транскриптазу, рядом с которой расположены повторяющиеся ДНК-сегменты, напоминающие структуру CRISPR. Хотя функция системы пока не ясна, она получила название array-associated reverse transcriptases (ART).

Для поиска этой системы автономные агенты Claude анализировали геномные данные, включающие около 1,9 миллиарда белковых кластеров. В течение 21 часа около 950 агентов собрали свыше 200 тысяч обратных транскриптаз и выделили 3500 потенциально новых систем, из которых лишь 20 были отобраны для более детального изучения. Работа, которую ИИ выполнил за считанные часы, могла бы занять у человека несколько недель или даже месяцев.

Claude заметил повторяющиеся последовательности рядом с геном изучаемой транскриптазы, сопоставил их с известными системами и проверил на основе научной литературы. Хотя сама транскриптаза уже описана ранее, открытие более сложной системы с рядом повторяющихся ДНК-сегментов и неизвестным геном представляет собой значительное достижение.

Anthropic использует Claude для выявления закономерностей и генерации гипотез в лабораторных условиях с уровнями безопасности BSL-1 и BSL-2, исключая работу с патогенами, опасными для человека. В прошлом, схожие повторяющиеся ДНК-сегменты были обнаружены в микроорганизмах, став основой для CRISPR, применяемого в генной инженерии.

Дальнейшие усилия Anthropic в биологии включают запуск программы Life Sciences Verification Program, предложенной 17 сентября. Эта инициатива предоставляет исследователям доступ к моделям Mythos 5.1, Opus 5 и Sonnet 5 с упрощенными условиями для выполнения биологических задач.

Anthropic также объявила о конкурсе на создание белков совместно с Adaptyv Bio, предлагая до $1 млн кредитов Claude и другие ресурсы. Это часть более широкой стратегии компании по использованию ИИ для ускорения фундаментальных биологических исследований, включая недавний запуск лаборатории в Сан-Франциско.