ИИ-агенты Claude раскрыли новую ферментную систему в ДНК бактериофагов

ИИ-агенты Claude от Anthropic совершили прорыв, обнаружив уникальную ферментную систему в ДНК бактериофагов, вирусов, атакующих бактерии. Вблизи найденного гена фермента расположены длинные повторы ДНК, напоминающие структуры CRISPR. Точная функция этой системы пока остаётся загадкой, но её открытие может стать новым этапом в биологических исследованиях.

Система, получившая название array-associated reverse transcriptases (ART), имеет организованные повторяющиеся последовательности, схожие с CRISPR-массивами. Claude получил задание от Anthropic найти необычные обратные транскриптазы, ферменты, преобразующие РНК в ДНК, среди 1,9 млрд белковых кластеров. В результате работы около 950 агентов в течение 21 часа было выявлено более 200 000 транскриптаз и выделено 20 наиболее перспективных для дальнейшего изучения.

Anthropic оценила, что аналогичная работа вручную заняла бы от нескольких недель до месяцев. В процессе анализа один из агентов обнаружил необычную ДНК-последовательность рядом с неизвестной транскриптазой. После сравнения с существующими системами и проверки научной литературы находка была передана на проверку учёным.

Хотя сама транскриптаза была известна из прежних исследований, новизна заключалась в выявлении более сложной системы с неизвестным геном и повторяющимися ДНК-участками. Лабораторные эксперименты проводились специалистами Anthropic, использующими безопасные уровни BSL-1 и BSL-2, не работающими с патогенными для человека микроорганизмами.

ART имеет длинный массив повторяющихся последовательностей, образующий короткие РНК, что привело к сравнению с CRISPR. Однако, Anthropic пока не нашла доказательств способности ART редактировать ДНК или распознавать генетические последовательности.

Anthropic активно развивает направление биологии, недавно запустив программу Life Sciences Verification Program для доступа к моделям Mythos 5.1, Opus 5 и Sonnet 5. В тот же день компания заявила о значительном ускорении более 30 открытых моделей для биомолекулярных исследований благодаря оптимизации, проведенной ИИ.

Anthropic также опубликовала оптимизированный код для обработки систем с более чем 10 000 молекулярных токенов на одном GPU-узле Nvidia. Совместно с Adaptyv Bio компания организовала конкурс по дизайну белков, предлагая до $1 млн в кредитах Claude и другие бонусы для участников.

Компания создала собственную лабораторию в районе залива Сан-Франциско для проведения исследований и проверки гипотез, а также ранее запустила среду Claude Science для учёных. В августе Стэнфордский университет впервые использовал ИИ для проектирования геномов бактериофагов, показав эффективность 16 из них против кишечной палочки.